Se extirpa la parte enferma del intestino delgado (íleon). Los dos extremos sanos se cosen volviéndolos a unir y se cierra la incisión.

Si es necesario detener el funcionamiento digestivo normal mientras el intestino sana, se realiza una abertura temporal (estoma) del intestino en el abdomen (ileostomía), la cual se cierra y se repara posteriormente. En algunos casos, si se remueve una porción grande del intestino, las ileostomías son permanentes.

El íleon absorbe la mayor parte del líquido de los alimentos. Cuando el intestino grueso es desviado por medio de una ileostomía, el paciente debe esperar tener heces líquidas. El drenaje frecuente de heces líquidas generalmente causa inflamación en la piel alrededor de la ileostomía. El cuidado esmerado de la piel y la colocación correcta de la bolsa de la ileostomía pueden disminuir la irritación.