Por lo general, los niños se recuperan rápidamente. Esta cirugía no presenta desventajas a largo plazo. Se necesita solamente uno o dos días de hospitalización.

Normalmente, la ingestión de alimentos por vía oral se hace después de que han pasado 12 horas de la operación debido a que el estómago requiere este corto período de tiempo para recuperar su capacidad de contraerse y vaciarse. La mayoría de los lactantes puede pasar progresivamente de alimentos líquidos claros a cantidades normales de fórmula para lactantes o leche materna dentro de las 36 horas después de la operación. No es extraño que se presenten vómitos en los primeros dos días.

La pequeña incisión en la parte superior derecha del abdomen del niño se cubre con esparadrapo. Puede observarse una protuberancia en el lugar de la incisión pero esto no es preocupante. Se debe evitar el baño por lo menos durante cinco días después de la operación. El día en que el bebé deja el hospital, se le puede bañar con esponja y se debe secar cuidadosamente el sitio de la incisión.