Alternativamente, los tubos de gastrostomía pueden colocarse con la ayuda de un endoscopio, haciendo una incisión mucho más pequeña (colocación de tubos de gastrostomía por endoscopía percutánea o PEG, por sus siglas en inglés).

La colocación de una sonda por endoscopía percutánea se puede hacer con anestesia local en vez de anestesia general. Se pasa un endoscopio por la boca, se baja por el esófago y se introduce en el estómago. Luego, el cirujano puede ver la pared estomacal a través de la cual pasará la sonda gástrica percutánea. Bajo observación directa con el endoscopio, se pasa la sonda gástrica a través de la piel del abdomen por una incisión muy pequeña y se introduce en el estómago. Después, se infla el balón en el extremo de la sonda para mantenerla en posición. Las sondas gástricas percutáneas evitan el uso de anestesia general y la realización de una incisión grande.